Akonáhle kaz dosiahne živú časť zubu – tzv. zubnú dreň, prebieha v nej zápalový proces. Zápal môže byť chronický – tzn. že sila bakterií je nižšia ako obranyschopnosť drene a zápal je v utlmenom stave. Môže sa však kedykoľvek aktivovať. V takom prípade sa prejavuje postupne sa predlžujúcimi epizódami bolesti.

Nech je klinický priebeh zápalu akýkoľvek, našou úlohou je koreňové kanáliky zbaviť bakterií, vydezinfikovať a zaplniť, aby do nich baktérie nemohli vniknúť znovu. Na záver každej endodontickej liečby je nevyhnutná dostavba stratených zubných tkanív fotokompozitnou (bielou výplňou), s alebo bez spevňujúceho sklovláknového čapu, podľa rozsahu strát zubných tkanív. Často je nutná i protetická rekonštrukcia zubu – korunka. Niekedy je potrebná oprava starej koreňovej výplně u mŕtvych zubov, pretože nie je dostatočne tesná a zostali pod ňou baktérie spôsobujúce infekciu.